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综合馆
用非线性预测方法研究蛋白质序列的特性(Ⅰ)
  • 摘要

    通过详细HP模型将一条蛋白质序列构造为3个特征序列.其中蛋白质序列取自蛋白质分类数据库CATH,该库将蛋白质序列根据不同结构域分为4类(α主类,β主类,αβ类,低二级结构类).然后采用非线性预测方法,研究每类蛋白质序列的特征序列,得到特征序列的误差比值(E-D)图.从图形上发现,每类蛋白质序列的每条特征序列的曲线起伏波动不断,具有特异性,且4类蛋白质序列对应特征序列的E-D图之间也有很大不同.

  • 作者

    管维红  徐振源  朱平  GUAN Wei-hong  XU Zhen-yuan  ZHU Ping 

  • 作者单位

    江南大学,信息工程学院,江苏,无锡,214122/江南大学,理学院,江苏,无锡,214122

  • 刊期

    2008年1期 ISTIC PKU

  • 关键词

    非线性预测方法  蛋白质序列  蛋白质分类 

参考文献
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