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综合馆
基于不同物种的热休克蛋白90的生物信息学分析
  • 摘要

    热休克蛋白90( Heat shock protein 90,Hsp90)是生物体受到刺激时发生应激反应而产生的一类应激蛋白。 Hsp90包含Hsp90A, Hsp90B, Hsp90C, TRAP和HtpG5个亚家族。本文采用生物信息学方法对所选11个物种的Hsp90基因进行了分析。统计Hsp90亚家族在物种间的分布情况,验证了Hsp90亚家族在物种间的分布规律,即Hsp90A亚家族分布于除细菌外的其他所有物种中,Hsp90B和TRAP1亚家族在物种间的分布无明显规律,Hsp90C亚家族只存在于植物中,HtpG亚家族大部分存在于细菌中。通过构建系统发育树,发现Hsp90家族在进化过程中具有保守性。使用Cell-PLoc, SubLoc v1.0, PSORT II和MultiLoc四种亚细胞定位软件对所选的11个物种的Hsp90进行亚细胞定位分析,发现Hsp90A,HtpG亚家族偏好出现在细胞质中,Hsp90B亚家族除存在于细胞质外还存在于内质网中,Hsp90C亚家族则集中于细胞质和线粒体中,TRAP1亚家族基本位于线粒体中。

  • 作者

    叶静  陈伟  金殿川  YE Jing  CHEN Wei  JIN Dianchuan 

  • 作者单位

    华北理工大学理学院,河北唐山,063009

  • 刊期

    2016年3期 ISTIC

  • 关键词

    热休克蛋白90  系统发育树  基因结构  亚细胞定位  Hsp90  Phylogenetic tree  Gene Structure  Subcellular localization 

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3.235.29.190