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综合馆
基于ISSR标记的山茱萸核心种质构建
  • 摘要

    山茱萸(Comus officinalis)是我国独有的木本中药材,良种培育对提高山茱萸产业效益有重要意义,种质资源是良种培育的基础.为了更加高效地开展山茱萸种质资源收集评价和保存利用,本研究从自全国11个省(市)采集129份山茱萸样品,利用11条简单重复序列区间(inter-simple sequence repeat,ISSR)引物进行PCR扩增,使用随机取样和位点优先取样两种聚类分析策略,分别采用简单匹配(simple matching,SM)遗传相似系数、Jaccard遗传相似系数和Nei&Li遗传相似系数3种遗传距离,进行核心种质的选择.用SPSS 19.0软件对原种质、核心种质和保留种质的群体遗传参数进行T检验,以评价核心种质的代表性和异质性,对原种质和核心种质的形态指标进行异质性检验,来确认核心种质的代表性.11条引物共从129个样品扩增出87个条带,全部为多态性位点,群体观测等位基因数(number of alleles,Na)为2.000 0,平均有效等位基因数(number of effective alleles,N0为1.438 8,平均Nei's遗传多样性指数(Nei's genetic diversity index,H)为0.259 3,平均香农信息指数(average Shannon's information index,D为0.400 6,表明收集的山茱萸材料在DNA分子水平上有较高的遗传多样性.聚类分析的结果,认为不同地区的居群间种质资源存在一定的地理隔离和遗传分化.根据6种聚类取样方法结果的比较,采用位点优先取样策略和Nei&Li遗传距离的S1D3组,选取出的34份样品,是6组初选种质中群体遗传多样性参数最高的,有效等位基因数、Nei's遗传多样性指数和香农信息指数均显著大于保留种质,遗传多样性较保留种质丰富.对比原种质和核心种质的叶片和果实的13个表型指标,除叶片宽、叶柄长和果干重3个性状有差异外,其他10个性状指标核心种质与原种质均无显著差异,所选的核心种质能够从表型指标上代表原种质资源.本研究从来自全国11个省(市)的129份山茱萸材料中抽取出34份,构建的核心种质,包含了原种质26.36%的样本.通过对核心种质和原种质、保留种质的群体遗传多样性参数进行比较,结合对13个表型性状的数据进行确认,构建的核心种质可以代表原种质的遗传多样性,研究的结果可以为山茱萸种质资源收集保存和新品种培育作参考.

  • 作者

    赵宁  杨孟莉  李继东  郑先波  谭彬  叶霞  赵志浩  冯建灿  ZHAO Ning  YANG Meng-Li  LI Ji-Dong  ZHENG Xian-Bo  TAN Bin  YE Xia  ZHAO Zhi-Hao  FENG Jian-Can 

  • 作者单位

    河南农业大学林学院,郑州,450002/河南农业大学园艺学院,郑州,450002/河南农业大学林学院,郑州450002;河南农业大学园艺学院,郑州450002

  • 刊期

    2017年4期 ISTIC PKU

  • 关键词

    山茱萸  核心种质  ISSR标记  位点优先策略  随机取样策略  Cornus officinalis  Core collection  ISSR markers  Allele preferred sampling strategy  Random sampling strategy 

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3.227.240.31